在Linux系统下运行Java程序的一种常见方式是通过运行可执行的JAR文件。JAR文件是Java应用程序的打包文件，其中包含了所有的程序代码、依赖库和资源文件。

要在Linux系统下运行JAR文件，首先需要确保系统已经安装了Java运行环境（JRE）。可以通过在终端输入java -version命令来检查系统是否已经安装了Java环境。

一旦确认系统已经安装了Java环境，就可以通过命令行来运行JAR文件。在终端中使用java -jar命令，后面跟上JAR文件的路径和文件名，即可启动Java应用程序。

如果JAR文件依赖于其他的库文件，可以通过在命令行中使用java -cp参数来指定类路径，以便程序能够找到所需的依赖库。

总的来说，在Linux系统下运行JAR文件非常简单，只需要确保系统已经安装了Java环境，并通过命令行来启动JAR文件即可。这种方式非常适合在服务器上部署和运行Java应用程序。